可以咨询村村通修路问题的政府部门是公路管理局。依据《中华人民共和国公路法》等相关法律，公路管理局负责公路建设、维护等工作。若不及时处理修路问题，可能影响村民出行和交通安全，造成不良社会影响。
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咨询村村通修路问题，可这样做：1.直接联系当地公路管理局，说明修路具体问题，请求处理。2.拨打当地政府服务热线，反映修路情况，由相关部门协调解决。3.若问题紧急或严重，可同时向村委会和上级交通部门报告，确保快速响应。
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处理村村通修路问题的常见方式有向公路管理局投诉或向当地政府热线反映。选择时应考虑问题性质和紧迫性，若涉及具体施工或维护问题，建议直接联系公路管理局；若需快速反馈或涉及多方面协调，可选当地政府热线。